Система образования в настоящее время может рассматриваться как фактор, негативно влияющий на здоровье обучающихся, прежде всего, через неадекватные учебные нагрузки, такой вывод сделан в ежегодном докладе «О положении детей в Красноярском крае в 2003 году». Для снижения учебной нагрузки вся первая ступень образования (начальная школа) в Красноярском крае переведена на срок обучения 4 года.
Для сохранения здоровья учащихся в 40% школ края добавлен третий урок физкультуры, а также реализуются профилактические программы: «Здоровый ребенок», «Разговор о правильном питании», «Мое здоровье и физическая культура», «Я и моя безопасность», функционирует сеть «Школ здоровья», центров содействия здоровью детей, на базе образовательных учреждений созданы федеральные экспериментальные площадки по проблемам сохранения здоровья детей.