Богучанская ГЭС обеспечивает необходимый для навигации уровень воды в Ангаре.
В июле средние расходы были чуть выше, но благодаря ливневым дождям, прошедшим на Ангаре в конце июля — начале августа, боковая приточность на участке ниже Богучанской ГЭС увеличилась, что позволило снизить расходы без вреда для навигации.
В связи с затянувшимся маловодьем на Ангарском каскаде одной из основных задач энергетиков является экономия водных ресурсов для обеспечения надёжной работы в зимний период. Богучанская ГЭС смогла снизить расходы через гидроагрегаты на 270 куб. м/с, сэкономив водные ресурсы и обеспечивая навигацию в полном объеме.
Навигация на Ангаре проходит с середины мая до середины октября. По распоряжению Енисейского бассейнового водного управления пропуск воды через Богучанскую ГЭС увеличен с 10 мая 2018 года — с 2000 куб. м/с до 2600 куб. м/с, а впоследствии и до 3200 куб. м/с. Такие расходы позволили судам Енисейского речного пароходства начать перевозку грузов по Ангаре и Енисею. На протяжении всей навигации расходы осуществляются только через гидроагрегаты, водосбросы станции не открывались.
По официальной информации, Енисейское речное пароходство планирует перевезти в навигацию 2018 года около 3,5 млн тонн грузов, в доставке задействованы около 430 судов различного назначения.
