Начнем с того, что первое слово ms word знает, а второе нет.
Однако это еще не значит, что такого слова нет - gramota.ru в курсе о существовании обоих слов.
Ну, а раз слова правильные, давайте узнаем, что они обозначают. Может, одно и то же?
Пренатальный период
Это период от возникновения чувствительности, которая позволяет говорить о наличии у ребенка субъективного переживания в самой элементарной форме до готовности к рождению.
Перинатальный период
Это период с 28-й недели беременности по 7-ые сутки жизни новорожденного, один из наиболее напряженных периодов жизни маленького человека - подготовка к родам, роды, первые дни приспособления к новому миру.
Как видим, эти слова не синонимичны, ведь сначала идет пренатальный период, а уже после него перинатальный.