Судя по всему, народное название тюрьмы связано с круглой формой ее здания. На сайте "Прогулки по Петербургу" опубликована следующая информация: «В 1828 году на территории Новой Голландии по проекту архитектора военного ведомства А. Е. Штауберта была построена Морская тюрьма. Сам архитектор во время проектирования назвал строение "Башней". За время её существования обиходное название видоизменялось, в конце концов в народе её стали называть "Бутылка"» (http://www.walkspb.ru/zd/nov_gol.html).
«В 1828 году на территории Новой Голландии по проекту архитектора военного ведомства А. Е. Штауберта была построена Морская тюрьма. Сам архитектор во время проектирования назвал строение "Башней". За время её существования обиходное название видоизменялось, в конце концов в народе её стали называть "Бутылка"» (http://www.walkspb.ru/zd/nov_gol.html).